На 27 ноември в Брюксел министърът на транспорта Петър Мутафчиев, на екологията - Джевдет Чакъров, и еврокомисарят по регионалната политика Данута Хюбнер подписаха официално двете оперативни програми - "Транспорт", която е най-голямата от седемте и възлиза на 2.003 млрд. евро, и "Околна среда" - за 1.8 млрд. евро. Церемонията се състоя в сградата на представителството на България в Европейския съюз.
Комисар Хюбнер поздрави България с подписването на програмите и заяви, че това е първата стъпка по един дълъг седемгодишен път. Програмата "Транспорт" е важна не само защото чрез нея се инвестират над 2 млрд. евро, но и защото ще подпомогне икономическия растеж чрез инвестиции в устойчив транспорт и изграждане на връзки с европейската транспортна мрежа. Комисар Хюбнер подчерта, че предизвикателствата днес са:
->изпълнението на оперативните програми
->необходимостта от инвестиции в качествена администрация
->добре разработени проекти.
Тя изрази своята увереност, че всяко евро ще бъде ефективно инвестирано за доброто бъдеще на България.
Министърът на транспорта Петър Мутафчиев благодари на всички допринесли за подготовката на оперативна програма "Транспорт", както и за личната ангажираност на комисар Хюбнер. Той насочи вниманието и към факта, че един от основните принципи при разработването на оперативната програма е подготовката на алтернативни проекти извън основните, заложени в програмата. По този начин се гарантира повишаването на усвояемостта от структурните и Кохезионния фонд на ЕС.
Околната среда е важна за България по две причини: защото тя е страна с много красива природа и трябва да се запази такава и защото инвестициите в околната среда са инвестиции в качеството на живот на хората, каза Данута Хюбнер. Тя посочи, че по оперативна програма "Околна среда" България ще получи 50 пъти повече средства, отколкото е получила от предприсъединителните фондове. Според еврокомисаря страната ни трябва да инвестира в повишаване на административния капацитет на местно ниво, защото от това зависи да се постигне максимално добро усвояване на средствата от всички оперативни програми. Министър Чакъров припомни, че по негово предложение в общините вече има изградени специални звена за управление на проекти. Министерството на околната среда и водите стартира втория етап от програмата за обучение на тези звена за подготовка и управление на проекти по оперативна програма "Околна среда".

Двете програми съставляват над 40% от субсидията - 3.8 млрд. евро,
от общо 6.8 млрд. по оперативните програми и 2.6 млрд. евро по плана за развитие на селските райони, т.е. общо 9.5 млрд. евро. След тях се нарежда регионалната програма с 1.6 млрд. евро. Само за пътища в транспортната са заложени почти 1 млрд. евро, за жп - 580 млн. евро, 211 млн. за корабоплаване, 156 - за интермодален транспорт.
По оперативна програма "Околна среда" в момента има готовност с проекти за 300 млн. евро. Очакванията са до края на 2008 г. да бъдат подписани договори за изпълнение на проекти на обща стойност над 500 млн. евро. Това съобщи министърът на околната среда и водите Джевдет Чакъров след официалното подписване на оперативната програма "Околна среда".
Той допълни, че 68% от средствата ще са за пречиствателни станции, водопроводи и канализация и подобряване на водните услуги в цялата страна. До момента има изградени 68 пречиствателни станции за отпадни води. До 2010 г. трябва да бъдат построени 74 пречиствателни станции за отпадни води в населени места над 10 хил. еквивалент жители. Специален приоритет ще бъде изграждането на пречиствателни станции по цялото ни Черноморие, за което са необходими 200 - 220 млн. евро. През 2008 г. ще стартират водни проекти във Враца, Габрово и Сливен. През 2009 г. ще започне подобряването на ВиК инфраструктурата в 12 града.
Министър Чакъров припомни, че в областта на отпадъците до средата на 2009 г. трябва да бъдат изградени 55 регионални депа за битови отпадъци. В момента работят 25 такива депа, девет се строят, а 21 са подготвени за стартиране на процедури по изграждането им. Със средства от Европейския съюз и бюджетно съфинансиране ще бъдат закрити и рекултивирани всички стари депа. В оперативната програма за управление на отпадъците са отделени 20% от парите. Сега се финансира затварянето на сметището на Русе. Предстои изграждане на депа в Провадия, Добрич и Бургас, подготвят се и още седем града за по-добро управление на отпадъците. Третият приоритет в прог­рамата е опазване на био­логичното разнообразие, за който са отделени 6%. 

Оперативна програма "Транспорт" 2007-2013 г.
Оперативна програма "Транспорт" 2007-2013 г. се финансира от Европейския фонд за регионално развитие и Кохезионния фонд на Европейския съюз. Бюджетът й за България е 2 003 481 163.68 евро.
Приоритетните оси на оперативна програма "Транспорт" са: железопътната и пътната инфраструктура по трансевропейските и основните национални транспортни оси, пътната инфраструктура, интермодалност на пътници и товари, по-доб­ри условия за корабоплаване и техническа помощ. С изпълнението им България ще започне да подобрява параметрите на европейската транспортна система чрез:
развитие на трансевропейската транспортна мрежа (TEN-T)
пренасочване на товарните превози от сухопътния транспорт към железопътния, морския и речния транспорт
развитие на модерен транспорт, за да бъде намален броят на частните превозни средства и съответно на емисиите от въг­лероден двуокис
увеличение на частните инвестиции в обществения транспорт.
По оперативна програма "Транспорт" се предвижда да бъдат реализирани 15 приоритетни проекта по четири основни приоритетни оси.
За железопътната инфраструктура са предвидени 580 млн. евро, бенефициент е Националната компания "Железопътна инфраструктура", парите са от Кохезионния фонд. Следва се политиката на трансевропейската мрежа  (TEN), споразумението за високоскоростни железопътни линии (AGC), споразумението за железопътните линии за комбиниран транспорт (AGTC) и трансевропейският железопътен проект (TER).
За втория приоритет - пътищата, са предвидени около 990  млн. евро от Кохезионния фонд, като бенефициент е фонд "Републиканска пътна инфраструктура". По него ще бъдат строени и рехабилитирани магистрали и първокласни пътища от национално и европейско значение и пътни отсечки, свързващи основната пътна мрежа на България с тези на съседните страни.
По приоритетна ос 3 - подобряване на интермодалността при превози на пътници и товари, предвидените инвестиции са 211 млн. евро. Дейностите се съфинансират от Европейския фонд за регионално развитие, бенефициенти са Националната компания "Железопътна инфраструктура" и Столична община - "Метрополитен" ЕАД. Ще се разширява мрежата от терминали за комбиниран транспорт и ще се развива подземната градска железница, свързваща ключови транспортни центрове от национално значение (централни гари, летища и др.) с други видове транспорт.
По приоритетна ос 4 за подобряване на условията за корабоплаване и морските и вътрешните водни пътища са заложени 157 млн. евро инвестиции. Дейностите се съфинансират от Европейския фонд за регионално развитие. Бенефициенти са Изпълнителна агенция "Морска администрация" и Изпълнителна агенция "Поддържане и проучване на река Дунав". Основните дейности са отстраняване на тесните места по река Дунав и изграждане и развитие на информационни системи за управление на трафика.